İyi ki doğdunuz
Fakat bu mahkumiyet Aliya'nın ve kitabının daha çok insana ulaşmasını sağladı. Kitabın muhtelif yollarla elde edilmesi ve yazarının hapiste olması okuyucularda duygusal derin bir bağ oluşturdu.Aliya hapiste olduğu dönemde yıllarını verdiği ve bir arkadaşının da neşrettiği "Doğu ve Batı Aɾasında İslam" adlı kitabı yayımlandı. Kitap kısa zamanda geniş biɾ kitleye ulaşarak büyük rağbet uyandırdı. İzetbegoviç, bu eseriyle İslam'ın özünü tüm insanlara ulaştırmak istiyordu.
Komünist rejimin dinlerin toplumsal yaşamı kısıtlamasına karşı duran Aliya İzetbegoviç, politik İslamı savunduğundan ve ateizme karşı olduğundan komünist yöneticilerin en önemli hedeflerinden biriydi. Bu sebeple 1949'da İslamcılık suçlamasıyla hapse girerek beş yıl hapis tutuldu. İslam'ın Balkanlar'daki mücadelesi 1953'te iktidara gelen Tito zamanında daha şiddetlendi.
Balkanlar'da gerçekleşen bağımsızlık mücadeleleri Avrupa ve ABD tarafından destekleniyor gibiydi. Sırplar kendilerine yapılan yardımlarla işgal ettikleri yerlerde hem katliam hem de yıkım gerçekleştiriyorlardı. Bosna-Hersek Cumhuriyeti Cumhurbaşkanı Aliya İzetbegoviç çok büyük askerî güce ve imkana sahip olan Sırplarla, her türlü askeri imkandan yoksun ve hiçbir dış desteğe sahip olmayan Bosna-Hersek halkını karşı karşıya getirmemek için yaşamı boyunca mücadele etti.